Shotgun（鸟枪法）蛋白质混合物鉴定
Shotgun（鸟抢法）蛋白质混合物鉴定的基本原理是蛋白质溶液或经过SDS-PAGE分离的蛋白质条带经过酶解后形成肽段混合物，肽段混合物经过一维液相色谱或二维液相色谱分离，串联质谱检测，然后通过在相应的数据库中检索，从而鉴定蛋白质
免疫共沉淀结合质谱技术蛋白互作
免疫共沉淀（co-inmunoprecipitation, Co-IP）技术是逐渐成为研究蛋白-蛋白间相互作用主要方法和手段，以细胞内源性靶蛋白为诱饵，将靶蛋白抗体与细胞总蛋白进行共孵育
Label-Free蛋白质相对定量分析
Label-Free是近年来重要的质谱定量方法，通过比较质谱分析次数或质谱峰强度，分析不同来源样品蛋白的数量变化。该技术无需昂贵的同位素标签做内标，提高了低丰度蛋白质的检测效率和蛋白质定量的准确性。
代谢组学
代谢组学是对某一生物体组份或细胞在一特定生理时期或条件下所有代谢产物同时进行定性和定量分析，以寻找出目标差异代谢物。可用于疾病早期诊断、药物靶点发现、疾病机理研究及疾病诊断等。